Em uma era moderna, onde o desconhecido é temido e evitado, a humanidade enfrenta seu maior pesadelo quando um monstro colossal emerge das profundezas do mar do Alasca. Zilla, uma criatura branca com listras pretas e um enigmático terceiro olho roxo, desperta de um sono milenar, desencadeando terremotos e tsunamis que devastam vilarejos costeiros e espalham o caos pelo mundo. A cientista Mary, fascinada por criaturas pré-históricas e radiação, lidera uma equipe de pesquisa para desvendar os mistérios de Zilla. À medida que estudam o monstro adormecido, Mary e seus colegas descobrem que estão lidando com uma força da natureza além de qualquer compreensão.