A Inquisição Portuguesa na colônia refere-se ao período em que a Inquisição, uma instituição da Igreja, estendeu sua autoridade e atividades para as colônias portuguesas, incluindo o Brasil. A Inquisição Portuguesa operou principalmente entre os séculos XVI e XVIII. A principal missão era identificar e perseguir aqueles que eram considerados hereges ou que praticavam atividades religiosas contrárias à doutrina católica. Isso incluía a busca por judeus convertidos ao cristianismo, mas suspeitos de continuarem a praticar a fé judaica em segredo (conversos), bem como a repressão de outras formas de heresia e apostasia.