O conhecimento dos custos educacionais pode auxiliar na gestão pública, além de ser uma importante ferramenta que pode facilitar o controle social dos recursos públicos. Este trabalho tem o objetivo de estimar o custo-aluno real de escolas municipais de Curitiba e analisar as disparidades entre os valores praticados. O cálculo é uma estimativa do custo-aluno real e refere-se ao montante destinado ao pagamento dos profissionais de educação. Como fonte foi utilizada a folha de pagamento e o Censo Escolar 2013. A análise considerou o total de 379 escolas. Os resultados mostraram que há uma grande diferença no valor do custo-aluno entre as escolas e que as etapas e modalidades influenciam nessa diferença. Ao analisar os custos por arranjo de etapas, foi possível observar que, apesar da variância entre os valores do custo-aluno ter diminuído, a diferença era mantida, indicando a existência de outros elementos influenciadores para além das etapas da educação. O mesmo ocorreu ao analisar o custo-aluno por etapa. As variáveis identificadas como influenciadoras do custo-aluno foram o número de docentes com formação em Ensino Médio, Ensino Superior ou Pós-graduação; o número de matrículas em tempo integral (sete ou mais horas); o nível socioeconômico da área de localização da escola; anos de serviço; e principalmente o número de alunos por turma e o número de alunos por docente.